37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2692 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  100 
 
 
169 aa  328  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  37.06 
 
 
154 aa  78.2  5e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  37.06 
 
 
154 aa  78.2  5e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.55 
 
 
325 aa  72.4  3e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  39.2 
 
 
122 aa  70.5  1e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  29.56 
 
 
175 aa  70.1  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  32.78 
 
 
173 aa  70.5  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  35.76 
 
 
156 aa  67.8  7e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  36.88 
 
 
170 aa  65.5  3e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  32.17 
 
 
153 aa  64.3  7e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  34.92 
 
 
167 aa  62  3e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  32.22 
 
 
175 aa  60.8  9e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  34.13 
 
 
167 aa  60.5  1e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  34.97 
 
 
333 aa  55.1  5e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  32.31 
 
 
160 aa  52  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  35.38 
 
 
331 aa  52.4  3e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  30.6 
 
 
163 aa  50.8  8e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  32.42 
 
 
181 aa  50.8  8e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  34.62 
 
 
331 aa  50.8  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  30.65 
 
 
124 aa  50.4  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  31.54 
 
 
160 aa  49.7  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  28.79 
 
 
165 aa  49.3  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  30.94 
 
 
185 aa  48.9  4e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  30.94 
 
 
172 aa  48.5  4e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  30.94 
 
 
172 aa  48.5  5e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  30.94 
 
 
164 aa  48.1  6e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  30.94 
 
 
164 aa  48.1  6e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  30.94 
 
 
164 aa  48.1  6e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.22 
 
 
320 aa  47.4  9e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  23.62 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  28.24 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  32.8 
 
 
372 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  29.1 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  27.48 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  27.15 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  28.57 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  29.93 
 
 
165 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>