More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05574 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  87.4 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  87.4 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  82.88 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  82.49 
 
 		 268 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  83.66 
 
 		 262 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  80 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 		 263 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  78.38 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  76.17 
 
 		 263 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  72.16 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  70.43 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  70.43 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  70.43 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  71.09 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  75.49 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  75.88 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  75.88 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  75.88 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  75.1 
 
 		 263 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 		 260 aa  304  9.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  64.92 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  64.92 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  63.97 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  62.25 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  61.04 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  61.85 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  58.3 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  61.2 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  56.85 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  53.63 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  57.43 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  55.28 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  55.69 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.13 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.15 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.96 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.4 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.6 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.6 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.65 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  40.08 
 
 		 663 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.8 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>