22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3576 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  98.75 
 
 		 160 aa  319  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  97.5 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  96.88 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  87.42 
 
 		 160 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  91.19 
 
 		 164 aa  291  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  87.42 
 
 		 160 aa  291  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  86.79 
 
 		 160 aa  290  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  90.51 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  89.94 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  90.51 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  52.53 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  46.58 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.14 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  27.52 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.48 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.56 
 
 		 602 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.03 
 
 		 566 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  38.1 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.45 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>