More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1410 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  84.96 
 
 
380 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  778    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  61.54 
 
 
380 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  45.91 
 
 
381 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  43.57 
 
 
371 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
398 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  48.63 
 
 
343 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  38.48 
 
 
375 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  37.97 
 
 
375 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  37.83 
 
 
384 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
376 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
381 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
398 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
386 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
360 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
408 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
384 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 
431 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  38.44 
 
 
417 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
382 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 
382 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
371 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
370 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
387 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
387 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.68 
 
 
375 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  39.72 
 
 
371 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
381 aa  169  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.41 
 
 
375 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 
385 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 
370 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
380 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
420 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
377 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
435 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
366 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
434 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
373 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.63 
 
 
351 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
390 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
428 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
384 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
371 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 
389 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
357 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.31 
 
 
372 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
346 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.87 
 
 
346 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
366 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.06 
 
 
372 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
378 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
395 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.13 
 
 
381 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  24.1 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
394 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
1241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
383 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  33.79 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.77 
 
 
815 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.62 
 
 
1219 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
1241 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.89 
 
 
364 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
535 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  32.53 
 
 
859 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
364 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
860 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  31.52 
 
 
430 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
361 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
374 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.2 
 
 
374 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
367 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
1028 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
364 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
417 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
1089 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.53 
 
 
419 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>