More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4099 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  97.66 
 
 		 428 aa  830    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  94.39 
 
 		 428 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  97.66 
 
 		 428 aa  828    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  88.35 
 
 		 428 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  81.29 
 
 		 423 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  850    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  81.29 
 
 		 423 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  70.78 
 
 		 432 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  70.31 
 
 		 432 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  70.31 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  69.52 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  70.6 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  67.84 
 
 		 435 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  70.6 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  63.88 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  56.62 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  57.96 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  56.02 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  55.91 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  55.48 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  57 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  54.68 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  54.68 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 420 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  53.53 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  53.53 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  56.31 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  51.57 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  52.64 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  51.45 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  51.57 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  52.58 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  52.43 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 423 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  48.95 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  48.95 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  49.64 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  48.95 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  48.95 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  48.71 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  48.01 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  48.66 
 
 		 424 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  51.43 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  51.43 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  51.43 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  48.57 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 415 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  34.89 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.12 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  32.47 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>