More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2344 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  93.76 
 
 		 449 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  901    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  59.63 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  62.17 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  58.89 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  60 
 
 		 450 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  60.23 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  61.87 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  62.98 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  46.21 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  46.05 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  45.67 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  46.67 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  46.67 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  43.86 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  43.12 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  43.99 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  44.22 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  43.64 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  43.12 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  43.36 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  46.93 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  42.95 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  46.9 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  42.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  42.69 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  42.89 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  43.02 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  43.36 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  43.19 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  43.78 
 
 		 451 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  42.96 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  42.76 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  42.96 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  42.53 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  42.69 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  42.07 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  41.57 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  42.07 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  42.07 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  42.07 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  42.07 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  41.11 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 413 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  43.12 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  42.6 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  42.57 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  43.25 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  44.11 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  42.82 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  42.82 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  42.82 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  42.37 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  42.37 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  44.58 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  42.22 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  42.22 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  42.53 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  44.52 
 
 		 453 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  42.66 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  43.35 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  43.35 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  42.15 
 
 		 447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  41.11 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 455 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>