More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1637 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  73.33 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  63.94 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  62.22 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  63.94 
 
 		 270 aa  361  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  62.83 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  61.34 
 
 		 270 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  62.08 
 
 		 270 aa  357  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  62.45 
 
 		 270 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  62.08 
 
 		 270 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  60.59 
 
 		 270 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  60.22 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  59.85 
 
 		 270 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  60 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  57.41 
 
 		 272 aa  341  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  58.15 
 
 		 270 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  58.36 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  56.99 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  54.31 
 
 		 289 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  54.1 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  57.68 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.906333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  57.68 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  55.64 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  57.3 
 
 		 272 aa  324  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  57.3 
 
 		 272 aa  324  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  54.51 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  57.3 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  57.3 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  56.3 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  55.26 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  57.25 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  54.89 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  57.25 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  57.25 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  54.07 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  57.25 
 
 		 268 aa  321  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  55.26 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  57.25 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  54.51 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  54.31 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  55.76 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  54.89 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  56.51 
 
 		 272 aa  318  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  54.51 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  56.51 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  54.51 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  54.14 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  54.14 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  54.14 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  53.01 
 
 		 268 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  54.14 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  53.36 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  53.38 
 
 		 269 aa  314  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  54.51 
 
 		 270 aa  314  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  53.38 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  53.7 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  52.63 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  56.3 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  52.42 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000275406  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  51.88 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  52.42 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  52.04 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  45.72 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  44.61 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.33 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  40.59 
 
 		 256 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  44.03 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  38.89 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  42.07 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  38.15 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.85 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.37 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  37.78 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  40.89 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.29 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.13 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  41.11 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  35.93 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.3 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  36.3 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  40.52 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  40.67 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  35.79 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>