More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0349 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 171 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.57 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.46 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.49 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  50 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>