More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1672 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  77.19 
 
 
295 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  76.56 
 
 
280 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  72.28 
 
 
302 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  69.52 
 
 
287 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  66.3 
 
 
276 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
623 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  33.18 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
376 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
373 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
306 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.15 
 
 
321 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
358 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
364 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
727 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
373 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
285 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
277 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
358 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
294 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
1007 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
318 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
330 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
1250 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.71 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.71 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  39.71 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  27.6 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  27.93 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  26.87 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  42.52 
 
 
347 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.29 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  38.64 
 
 
341 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
244 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 
338 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
308 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  26.87 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.86 
 
 
266 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  26.87 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.68 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
327 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1177 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
1035 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
334 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.18 
 
 
367 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 
251 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  41.38 
 
 
255 aa  89  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
316 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  28.34 
 
 
1165 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  28.34 
 
 
1165 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 
337 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
704 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
331 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  32.84 
 
 
249 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
335 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
350 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  31.9 
 
 
1171 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>