30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1135 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  919    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  55.68 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  21.52 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  24.62 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.12 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  31.17 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  24.31 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  23.23 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  24.14 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.02 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  22.81 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.47 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  25.1 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  27.93 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  40 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  24.85 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  41.3 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  35.53 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  47.5 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  37.04 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.59 
 
 		 616 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  47.5 
 
 		 560 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  45 
 
 		 570 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  47.5 
 
 		 558 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  36.84 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  45 
 
 		 581 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  35.21 
 
 		 562 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  30.84 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>