30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0032 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 257 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  73.83 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  70.43 
 
 		 257 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  44.71 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  37.76 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  38.72 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  40.87 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  38.43 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  34.48 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.03 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.44 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  35.44 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  38.5 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  32.38 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  37.61 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  31.54 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  30.34 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  32.67 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  29.57 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  33.57 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.71 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  33.08 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  28.33 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.85 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  36.71 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  27.17 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  26.61 
 
 		 179 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>