More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1911 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  516  1e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  93.73 
 
 
255 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  81.67 
 
 
263 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  79.28 
 
 
262 aa  405  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  79.92 
 
 
262 aa  406  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  81.63 
 
 
266 aa  404  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  79.28 
 
 
262 aa  405  1e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  79.27 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  78.14 
 
 
258 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  78.05 
 
 
261 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  77.64 
 
 
261 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  77.73 
 
 
258 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  77.96 
 
 
258 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  78.37 
 
 
258 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  76.42 
 
 
258 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  76.92 
 
 
258 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  76.92 
 
 
258 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  76.73 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  77.55 
 
 
258 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  70.9 
 
 
268 aa  356  2e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  69.53 
 
 
264 aa  355  3e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  69.44 
 
 
268 aa  355  3e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  71.02 
 
 
265 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  71.6 
 
 
263 aa  352  3e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  69.76 
 
 
262 aa  352  3e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  69.57 
 
 
264 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  70.08 
 
 
244 aa  348  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  67.58 
 
 
256 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  67.21 
 
 
240 aa  345  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  70.68 
 
 
251 aa  344  9e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  69.57 
 
 
255 aa  343  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  70.28 
 
 
250 aa  341  6e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  67.86 
 
 
268 aa  337  1e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  72.13 
 
 
240 aa  332  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  65.57 
 
 
240 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  66.94 
 
 
241 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  62.3 
 
 
241 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  62.3 
 
 
241 aa  315  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 
246 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  60.66 
 
 
241 aa  314  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  60.23 
 
 
259 aa  313  2e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.84 
 
 
241 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.3 
 
 
241 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  63.22 
 
 
241 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.07 
 
 
241 aa  307  1e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  60.66 
 
 
241 aa  306  1e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.48 
 
 
241 aa  306  2e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  65.04 
 
 
263 aa  306  2e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  63.37 
 
 
241 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  305  4e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 
241 aa  305  4e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.4 
 
 
282 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  64.46 
 
 
239 aa  304  8e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  60.25 
 
 
241 aa  304  8e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  61.98 
 
 
333 aa  303  2e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.84 
 
 
241 aa  303  3e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.25 
 
 
241 aa  302  4e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.25 
 
 
241 aa  302  4e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.43 
 
 
241 aa  301  5e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  59.84 
 
 
241 aa  301  6e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  62.81 
 
 
239 aa  301  6e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  59.84 
 
 
241 aa  301  8e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.84 
 
 
241 aa  301  8e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  60.25 
 
 
241 aa  301  8e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  60.87 
 
 
282 aa  301  8e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
241 aa  301  8e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  58.2 
 
 
265 aa  300  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59.13 
 
 
310 aa  299  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  61.16 
 
 
332 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
241 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  62.96 
 
 
240 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  62.3 
 
 
241 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  57.79 
 
 
265 aa  298  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
240 aa  298  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  59.6 
 
 
289 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  62.3 
 
 
241 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.2 
 
 
289 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  61.16 
 
 
317 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 
243 aa  297  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  61.57 
 
 
241 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  58.89 
 
 
283 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>