226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0971 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1014    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  52.71 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  51.46 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  50.9 
 
 		 522 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  50.7 
 
 		 522 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  50.7 
 
 		 522 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  50 
 
 		 520 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  51.32 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  50.91 
 
 		 522 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  50 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  50.5 
 
 		 522 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  50.6 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  50.3 
 
 		 522 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  49.6 
 
 		 529 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  49.8 
 
 		 529 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  50.93 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  50.93 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  50.93 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  49.59 
 
 		 544 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  50.93 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  50.93 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  50.93 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  50.72 
 
 		 521 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  50.31 
 
 		 507 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  49.48 
 
 		 521 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  50.21 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  48.74 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  47.98 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  48.75 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  49.79 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  48.96 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  47.81 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  47.65 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  48.76 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  48.33 
 
 		 488 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  46.23 
 
 		 486 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  47.22 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  47 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  48.64 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  46.03 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  45.62 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  45.62 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0878  protein of unknown function UPF0061  72.35 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  46.44 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  46.44 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  46.34 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  44.38 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  43.84 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  44.98 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  43.42 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  44.92 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  44.61 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  47.07 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  43.87 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  43.87 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  43.87 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  43.81 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  44.89 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  44.92 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  43.81 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  42.28 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  44.54 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  47.42 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  44.92 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  47.42 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  44.54 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  43.66 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  47.42 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  44.54 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  44.54 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  47.42 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  44.12 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  43.51 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  47.18 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  44.1 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  44.1 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  46.02 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  45.88 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  43.12 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  43.06 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  41.77 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  43.52 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  42.49 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  41.44 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  40.57 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  40.54 
 
 		 521 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  40.78 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  40.37 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  39.36 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  41.08 
 
 		 494 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  40.57 
 
 		 484 aa  349  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  41.42 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  39.84 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  40.45 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  41.39 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  41.53 
 
 		 484 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  39.96 
 
 		 517 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  38.97 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  40.71 
 
 		 491 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  41.53 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>