More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0096 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  91.49 
 
 		 283 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  75.57 
 
 		 279 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  75.57 
 
 		 277 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  75.57 
 
 		 277 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  74.23 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  71.64 
 
 		 283 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  73.58 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  73.58 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  73.11 
 
 		 273 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  72.73 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  72.73 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  73.21 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  72.73 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  72.73 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  71.97 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  74.32 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  72.35 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  72.35 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  73.54 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  67.82 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  67.9 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  67.8 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  67.8 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  68.85 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  65.31 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  66.79 
 
 		 271 aa  363  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  67.3 
 
 		 282 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  68.46 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  64.29 
 
 		 279 aa  348  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  68.46 
 
 		 309 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  65.5 
 
 		 277 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  60.69 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  62.6 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  62.21 
 
 		 270 aa  332  5e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  60.77 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  60.15 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  60.32 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  61.35 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  58.57 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  57.47 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  58.57 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  57.31 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  58.17 
 
 		 269 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.77 
 
 		 269 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  57.78 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  57.37 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  57.37 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  56.92 
 
 		 265 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.2 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  56.52 
 
 		 265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  60.38 
 
 		 267 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  58.2 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.2 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  56.57 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  59.23 
 
 		 267 aa  298  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  55.42 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  57.69 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  54.58 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  57.69 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 269 aa  295  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.31 
 
 		 272 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  56.15 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  56.92 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  60.47 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  53.79 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  56.92 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  58.4 
 
 		 274 aa  291  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  56.92 
 
 		 272 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  56.52 
 
 		 279 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  56.52 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  56.52 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  54.28 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  52.19 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  58.5 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  56.52 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.25 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  59.84 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  56.92 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.92 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.2 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  55.34 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  59.06 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.92 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.92 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.92 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.15 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.15 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.15 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>