More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0277 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  90.52 
 
 		 464 aa  865    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  91.38 
 
 		 468 aa  880    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  90.52 
 
 		 464 aa  872    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  70.81 
 
 		 465 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  91.16 
 
 		 499 aa  877    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  89.22 
 
 		 464 aa  867    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  89.66 
 
 		 464 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  69.47 
 
 		 457 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  93.32 
 
 		 464 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  70.35 
 
 		 478 aa  658    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  72.15 
 
 		 467 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  90.73 
 
 		 464 aa  874    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 464 aa  950    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  71.65 
 
 		 462 aa  692    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  72.91 
 
 		 475 aa  671    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  91.16 
 
 		 464 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  74.08 
 
 		 466 aa  721    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  74.41 
 
 		 469 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  77.46 
 
 		 467 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  74.28 
 
 		 467 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  69.91 
 
 		 457 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  71.49 
 
 		 468 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  93.97 
 
 		 464 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  70.15 
 
 		 491 aa  682    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  78.57 
 
 		 469 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  70.18 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  68.81 
 
 		 470 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  65.66 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  66.81 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  66.88 
 
 		 471 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  65.96 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  65.36 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  64.78 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  65.94 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  65.55 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  67.41 
 
 		 463 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  64.26 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  65.94 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  65.21 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 		 469 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  65.93 
 
 		 490 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  63.18 
 
 		 465 aa  601  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  66.15 
 
 		 469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  62.93 
 
 		 469 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  66.01 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2434  argininosuccinate lyase  65.49 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  65.79 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  62.5 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  61.34 
 
 		 483 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  61.83 
 
 		 493 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 		 458 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  61.28 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  60.35 
 
 		 461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 		 458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  61.54 
 
 		 486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  61.54 
 
 		 486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  61.18 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  60.09 
 
 		 476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  60.94 
 
 		 485 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  61.37 
 
 		 458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  59.91 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  59.83 
 
 		 488 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  60.93 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  55.07 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  57.46 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  55.46 
 
 		 456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  57.17 
 
 		 471 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  55.85 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  55.63 
 
 		 463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  56.96 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  57.65 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  55 
 
 		 476 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  56.28 
 
 		 471 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  57.53 
 
 		 466 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  54.42 
 
 		 459 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  54.38 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  56.71 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  52.84 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  55.33 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  54.81 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  53.45 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>