More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3880 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 455 aa  936    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.75 
 
 		 401 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  39.11 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.38 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 355 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  38.55 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.55 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 355 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 396 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  32.54 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.59 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.38 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  36.74 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 904 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.74 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.46 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 407 aa  94  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.3 
 
 		 406 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.87 
 
 		 406 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 387 aa  93.2  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.33 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 414 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.33 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  33.98 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 372 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 377 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.77 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  37.7 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.33 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.43 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.77 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.77 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>