More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1716 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.56 
 
 		 555 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.25 
 
 		 536 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  57.3 
 
 		 552 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  60.08 
 
 		 534 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.74 
 
 		 542 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  58.6 
 
 		 535 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.76 
 
 		 531 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  55.24 
 
 		 533 aa  636    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.74 
 
 		 541 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.2 
 
 		 538 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  59.62 
 
 		 555 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.3 
 
 		 532 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  57.14 
 
 		 543 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.85 
 
 		 534 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  100 
 
 		 545 aa  1117    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  59.14 
 
 		 538 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.26 
 
 		 537 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.12 
 
 		 540 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  57.14 
 
 		 551 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.13 
 
 		 547 aa  663    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.85 
 
 		 558 aa  661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.41 
 
 		 534 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.38 
 
 		 533 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58.38 
 
 		 535 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58.38 
 
 		 535 aa  646    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.7 
 
 		 540 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.55 
 
 		 535 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  59.02 
 
 		 531 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  58.13 
 
 		 534 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59.74 
 
 		 553 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  59.13 
 
 		 554 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.74 
 
 		 533 aa  666    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  56.49 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.62 
 
 		 548 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59.43 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  59.43 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.64 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.06 
 
 		 547 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.88 
 
 		 550 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.97 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  56.59 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  56.64 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  56.59 
 
 		 543 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  56.64 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  56.48 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.08 
 
 		 530 aa  629  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.51 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  56.43 
 
 		 542 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.6 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  55.97 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.97 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.6 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  58.71 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.78 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  56.43 
 
 		 542 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  57.49 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.43 
 
 		 542 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.78 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.97 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  55.84 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  55.49 
 
 		 536 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.6 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.93 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  58.21 
 
 		 536 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.07 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  55.49 
 
 		 536 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  57.76 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.6 
 
 		 535 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.97 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  58.71 
 
 		 533 aa  623  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  58.46 
 
 		 563 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  56.64 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.55 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.7 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  55.23 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  56.62 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  56.1 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.45 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  58.75 
 
 		 565 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  55.91 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  57.64 
 
 		 542 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  55.54 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  54.9 
 
 		 550 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  58.95 
 
 		 569 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.89 
 
 		 533 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  56.39 
 
 		 531 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  56.07 
 
 		 534 aa  614  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  57.74 
 
 		 559 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  56.77 
 
 		 549 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.07 
 
 		 533 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  58.76 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  56.51 
 
 		 545 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  57.09 
 
 		 542 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  54.6 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  54.14 
 
 		 539 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  55 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  55.49 
 
 		 543 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  56.67 
 
 		 544 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>