55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0014 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  100 
 
 		 313 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  49.08 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  49.07 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  48.57 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  49.61 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  48.16 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  50.64 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  48.3 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  50.81 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  52.72 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  46.46 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  44.58 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  46.12 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  45.62 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  40.43 
 
 		 233 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  40.09 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  41.13 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  41.13 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  38.67 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  36.48 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  40.74 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.28 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.43 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  35.75 
 
 		 239 aa  93.2  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.43 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  34.24 
 
 		 210 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  32.47 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  31.03 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  31.22 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  31.22 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  30.73 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  32.16 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  31.28 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  31.46 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  32.34 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  32.34 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  30.14 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  30.34 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  29.21 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  30.23 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  30.46 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.62 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.72 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.78 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  28.22 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.07 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  26.09 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  25.4 
 
 		 229 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  26.11 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  28.82 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  24.47 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  24.74 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  27.21 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  26.88 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>