More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3637 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  60.74 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  67.48 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  66.67 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  63.41 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  59.4 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  59.4 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  59.4 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  60.47 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  58.39 
 
 		 171 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 		 165 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  55.88 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  63.33 
 
 		 208 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  54.14 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  54.89 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  54.14 
 
 		 168 aa  153  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  58.73 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  53.28 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 195 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  59.4 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  59.4 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  57.46 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  54.2 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  54.69 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  56.06 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  53.66 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  53.66 
 
 		 142 aa  136  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  51.88 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  55.65 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  54.47 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  52.85 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  52.85 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  44.53 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  42.52 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  40.8 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.23 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.84 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  41.49 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  30.91 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  31.15 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.77 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  31.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  33.64 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  32.8 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  37.11 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  29.13 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  40.74 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  32.32 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.4 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1915  ferric uptake regulator family protein  28.42 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.934218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  35.79 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.65 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  36.27 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.32 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.32 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  32.32 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  32.32 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.98 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  33.33 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>