247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3602 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  53.02 
 
 		 1029 aa  958    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  56.01 
 
 		 934 aa  1044    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  53.25 
 
 		 953 aa  932    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  54.59 
 
 		 937 aa  926    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  55.68 
 
 		 969 aa  993    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  50.68 
 
 		 941 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  53.05 
 
 		 925 aa  932    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  47.63 
 
 		 930 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  47.19 
 
 		 930 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  52.15 
 
 		 968 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  51.69 
 
 		 936 aa  894    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  53.24 
 
 		 931 aa  965    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  50.92 
 
 		 932 aa  931    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  49.83 
 
 		 912 aa  855    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  45.7 
 
 		 914 aa  800    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  52.15 
 
 		 928 aa  932    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  52.17 
 
 		 931 aa  950    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  50.59 
 
 		 933 aa  946    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  52.48 
 
 		 931 aa  956    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 989 aa  695    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  52.75 
 
 		 936 aa  956    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  47.68 
 
 		 893 aa  814    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  51.07 
 
 		 935 aa  875    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  55.42 
 
 		 912 aa  977    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  53.56 
 
 		 928 aa  933    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  47.63 
 
 		 930 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  56.91 
 
 		 934 aa  1040    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  51.74 
 
 		 941 aa  909    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  51.86 
 
 		 928 aa  932    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  45.61 
 
 		 936 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  52.48 
 
 		 968 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  55.9 
 
 		 934 aa  1042    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  45.09 
 
 		 943 aa  815    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  44.48 
 
 		 938 aa  728    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  54.82 
 
 		 949 aa  1002    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  52.01 
 
 		 933 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 931 aa  1903    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  52.83 
 
 		 935 aa  923    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.62 
 
 		 924 aa  618  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.86 
 
 		 936 aa  565  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  35.34 
 
 		 899 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.87 
 
 		 894 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.76 
 
 		 894 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  35.18 
 
 		 902 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 898 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  33.63 
 
 		 906 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.09 
 
 		 900 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.6 
 
 		 905 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2766  (protein-PII) uridylyltransferase  50.55 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.66342  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.33 
 
 		 894 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  34.06 
 
 		 900 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  34.11 
 
 		 877 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  34.1 
 
 		 900 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  35.16 
 
 		 859 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  32.93 
 
 		 899 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.69 
 
 		 893 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  35.04 
 
 		 859 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
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NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  33.41 
 
 		 900 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
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NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  34.36 
 
 		 858 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.19 
 
 		 899 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  33.77 
 
 		 900 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.47 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  33.65 
 
 		 900 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  35.08 
 
 		 857 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  32.72 
 
 		 900 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  34.39 
 
 		 858 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  33.68 
 
 		 899 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  34.92 
 
 		 858 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  34.61 
 
 		 927 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  33.1 
 
 		 852 aa  442  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  32.66 
 
 		 858 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  34.6 
 
 		 859 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  33.87 
 
 		 856 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  31.9 
 
 		 898 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.69 
 
 		 930 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  34.6 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 930 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.41 
 
 		 900 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.81 
 
 		 930 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  34.41 
 
 		 862 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  32.82 
 
 		 898 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.83 
 
 		 892 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  34.16 
 
 		 862 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  34.18 
 
 		 869 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  33.5 
 
 		 890 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.13 
 
 		 864 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  33.57 
 
 		 881 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 		 891 aa  422  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 889 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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