168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2261 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  714    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  52.14 
 
 
390 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  51.1 
 
 
375 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  51 
 
 
379 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  50.69 
 
 
375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  54.42 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  50 
 
 
376 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  49.86 
 
 
376 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  49.86 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  54.08 
 
 
355 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  51.41 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  52.59 
 
 
367 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  47.78 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  50.7 
 
 
357 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  53.11 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  49.58 
 
 
351 aa  305  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  54.15 
 
 
356 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  43.34 
 
 
367 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  51.3 
 
 
363 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  53.11 
 
 
353 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  49.17 
 
 
351 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  45.51 
 
 
366 aa  289  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  44.96 
 
 
363 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  43.26 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  43.34 
 
 
377 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  45.07 
 
 
358 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  49.32 
 
 
369 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  43.34 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  49.57 
 
 
371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  52.97 
 
 
362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  45.01 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  52.25 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  44.73 
 
 
365 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  52.16 
 
 
361 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  53.01 
 
 
361 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  42.49 
 
 
366 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  50.57 
 
 
364 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  56.61 
 
 
351 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  48.76 
 
 
324 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  38.86 
 
 
335 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  36.64 
 
 
335 aa  266  5e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  46.97 
 
 
339 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  36.96 
 
 
349 aa  249  7e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  38.2 
 
 
461 aa  246  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  37.47 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  40.1 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  35.5 
 
 
323 aa  226  4e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  33.17 
 
 
515 aa  219  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  34.42 
 
 
504 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.53 
 
 
370 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  34.29 
 
 
349 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  35.31 
 
 
387 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.28 
 
 
393 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.15 
 
 
384 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.16 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  32.7 
 
 
393 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  33.97 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.34 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  31.02 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  26.03 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.75 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.94 
 
 
397 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.92 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.92 
 
 
386 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  28.92 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  33.06 
 
 
386 aa  126  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.58 
 
 
368 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  31.89 
 
 
394 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  33.42 
 
 
393 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  34.93 
 
 
410 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.87 
 
 
370 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  34.93 
 
 
410 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  29.83 
 
 
386 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  33.69 
 
 
398 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  29.14 
 
 
394 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  33.79 
 
 
404 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.68 
 
 
370 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  34.16 
 
 
410 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  30.87 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  29.95 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  29.95 
 
 
377 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.75 
 
 
385 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  32.87 
 
 
397 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.62 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  31.04 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.86 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  33.06 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  31.86 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  31.09 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  32.87 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  32.99 
 
 
424 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.24 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  28.81 
 
 
410 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  31.36 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>