More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0817 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  100 
 
 
629 aa  1279  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
594 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.51 
 
 
600 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 
622 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
600 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  39.24 
 
 
614 aa  417  1e-115  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.84 
 
 
611 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.82 
 
 
592 aa  405  1e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  39.57 
 
 
588 aa  406  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  38.27 
 
 
613 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  37.38 
 
 
611 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  38.2 
 
 
611 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.58 
 
 
610 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  36.03 
 
 
608 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.78 
 
 
597 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
607 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  42.54 
 
 
650 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.71 
 
 
592 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  40.96 
 
 
619 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36.88 
 
 
603 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.64 
 
 
590 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.71 
 
 
602 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.93 
 
 
597 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.93 
 
 
597 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  34.33 
 
 
588 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.03 
 
 
587 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
603 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.74 
 
 
637 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  35.28 
 
 
602 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.6 
 
 
635 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.95 
 
 
586 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  40.73 
 
 
622 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.06 
 
 
591 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  36.89 
 
 
608 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.18 
 
 
632 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.48 
 
 
620 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.18 
 
 
632 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  40.49 
 
 
610 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.95 
 
 
589 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  40.49 
 
 
610 aa  363  5e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  35.78 
 
 
592 aa  363  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.26 
 
 
617 aa  362  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.12 
 
 
614 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  35.08 
 
 
588 aa  362  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.24 
 
 
623 aa  362  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.99 
 
 
597 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.64 
 
 
594 aa  360  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  34.38 
 
 
625 aa  360  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.37 
 
 
594 aa  358  1e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.25 
 
 
581 aa  358  1e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  36.68 
 
 
610 aa  358  2e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.67 
 
 
608 aa  358  2e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.33 
 
 
556 aa  357  3e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.5 
 
 
617 aa  356  6e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.64 
 
 
602 aa  354  3e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  35.17 
 
 
616 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.91 
 
 
594 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.78 
 
 
620 aa  353  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 
589 aa  349  8e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.99 
 
 
602 aa  349  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.11 
 
 
586 aa  348  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.83 
 
 
609 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.84 
 
 
598 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.6 
 
 
579 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 
637 aa  347  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
600 aa  346  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
598 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.67 
 
 
587 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  38.04 
 
 
621 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 
587 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
592 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.87 
 
 
637 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.67 
 
 
587 aa  343  6e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.99 
 
 
625 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.36 
 
 
631 aa  341  3e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
811 aa  339  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.44 
 
 
640 aa  339  1e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.67 
 
 
587 aa  338  3e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  32.39 
 
 
626 aa  337  3e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  37.37 
 
 
585 aa  337  4e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.32 
 
 
592 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.56 
 
 
607 aa  337  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.42 
 
 
606 aa  336  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
587 aa  336  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 
587 aa  336  8e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  32.94 
 
 
587 aa  336  8e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 
587 aa  336  8e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 
587 aa  336  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.44 
 
 
589 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
587 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  31.04 
 
 
636 aa  335  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  32.04 
 
 
584 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.19 
 
 
584 aa  334  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  38.6 
 
 
592 aa  334  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 
587 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.97 
 
 
598 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.11 
 
 
604 aa  333  8e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  38.22 
 
 
626 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  37.84 
 
 
677 aa  332  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.26 
 
 
609 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>