More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4042 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 358 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 		 727 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.39 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.18 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.57 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 1250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 663 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.63 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  40.3 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 597 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 280 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  32.72 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 230 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.22 
 
 		 254 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 1035 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 249 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 289 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 255 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.46 
 
 		 255 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 703 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 581 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 244 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 303 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.23 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 801 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>