More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2891 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  877    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.49 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.56 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.49 
 
 		 432 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2316  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.8 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  38.01 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  45.57 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  43.61 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  45.29 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.12 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  35.52 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  43.3 
 
 		 433 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  37.15 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  36.19 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  36.19 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  33.26 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  33.03 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  33.03 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  32.8 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  33.03 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  32.49 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  32.49 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  32.72 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.8 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  32.8 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  32.8 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  32.8 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  32.04 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  32.04 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  32.99 
 
 		 451 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  32.59 
 
 		 437 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  32.17 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 535 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  34.85 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  32.25 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 546 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  35.42 
 
 		 347 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 523 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 550 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 535 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  39.14 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  33.92 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  40.07 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  37.41 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  39.34 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  37.81 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  28.28 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  38.63 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  32.7 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.67 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.54 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  32.39 
 
 		 561 aa  156  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.64 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 453 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  34.43 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  36 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  35 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2801  sensor protein RstB, putative  35.44 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>