More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2236 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  91.38 
 
 		 446 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  100 
 
 		 449 aa  896    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  91.12 
 
 		 446 aa  792    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  56.7 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  56.18 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  56.18 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  55.58 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  56.39 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  50.59 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.18 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  50.24 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  45.94 
 
 		 436 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  47.75 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  46.99 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  43.79 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  44.69 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  43.09 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  43.33 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  43.09 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  44.99 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  44 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  44 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  44 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  44.76 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  44 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  44 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  42.69 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  44.76 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  43.76 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  43.9 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  44 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  43.76 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  42.66 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  40.77 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  43.06 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  43.64 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  40.09 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  41.4 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  43.41 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  42.39 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  43.18 
 
 		 450 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  42.95 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  44.13 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  43.39 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  42.59 
 
 		 432 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  42.59 
 
 		 432 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  42.59 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  42.36 
 
 		 450 aa  358  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  43.51 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  42 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  42.46 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  42.46 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  42.46 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  42.46 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  42.46 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  41.53 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  41.41 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  42.82 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  42.09 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  42.42 
 
 		 450 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  40 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  40 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  42.46 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  41.08 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  41.08 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  41.08 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  41.08 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  41.98 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>