71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1076 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  100 
 
 		 174 aa  361  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  93.64 
 
 		 173 aa  344  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  81.61 
 
 		 178 aa  308  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  48.28 
 
 		 174 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.7 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  47.7 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  45.29 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  43.5 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  43.27 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  46.24 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  43.1 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  36.31 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  37.97 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  31.53 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  32.43 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  27.56 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  28.06 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  32.38 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  23.78 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  31.07 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.7 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  32.61 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  28.95 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  25.71 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  26.06 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  24.86 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  26.28 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  25 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  25 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  25.71 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  28.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.37 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  28.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  28.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  28.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  26.26 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  19.46 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  21.02 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  22.44 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  28.89 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.78 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  28.89 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  23 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  22.37 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  23.4 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.56 
 
 		 210 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 240 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  21.92 
 
 		 251 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  22.22 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  24.82 
 
 		 292 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>