229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1800 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  100 
 
 
402 aa  826    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  26.3 
 
 
394 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
399 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
399 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
405 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  23.53 
 
 
399 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  24.82 
 
 
413 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
406 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
417 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
405 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  24.1 
 
 
413 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
274 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  30.53 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  22.38 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  22.69 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  26.55 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  26.99 
 
 
402 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
409 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  22.61 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.7 
 
 
402 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
413 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.12 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  31.87 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.07 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  21.16 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
422 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.45 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  28.65 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
1156 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
703 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
1340 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  26.32 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  20.18 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
1106 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  22.33 
 
 
1119 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  22.75 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.68 
 
 
442 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
892 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  20.33 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  28.23 
 
 
476 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.63 
 
 
860 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  20.83 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.82 
 
 
700 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
535 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.97 
 
 
537 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  32.17 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
468 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>