More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0012 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  684  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.39505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
364 aa  136  6e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
369 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
373 aa  129  7e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 
413 aa  129  8e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
419 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 
431 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 
448 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
386 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  2.03392e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
328 aa  121  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
335 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  33.75 
 
 
419 aa  119  5e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  38.17 
 
 
401 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  32.59 
 
 
401 aa  119  8e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
346 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 
402 aa  118  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
356 aa  118  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.15819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
439 aa  118  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 
316 aa  118  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
360 aa  117  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.49 
 
 
404 aa  117  2e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
424 aa  118  2e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.5793e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.91 
 
 
395 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.41 
 
 
390 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
338 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
350 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
448 aa  116  7e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 
327 aa  115  7e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
384 aa  115  7e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
369 aa  115  8e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
419 aa  115  8e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
345 aa  115  9e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
412 aa  115  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
316 aa  115  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
395 aa  115  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
318 aa  115  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
399 aa  114  2e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
396 aa  114  2e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
304 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
417 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
366 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
389 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.32 
 
 
394 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  38.73 
 
 
402 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
406 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
377 aa  113  4e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 
350 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
364 aa  112  7e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  31.58 
 
 
409 aa  111  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  37.35 
 
 
352 aa  112  1e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
328 aa  112  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
396 aa  112  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
402 aa  110  2e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 
338 aa  111  2e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
304 aa  111  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  36.99 
 
 
403 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
403 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
410 aa  110  4e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
370 aa  110  4e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
388 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  39.29 
 
 
362 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
411 aa  109  7e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
393 aa  108  9e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
398 aa  108  9e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 
436 aa  108  9e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  34.87 
 
 
414 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.68614e-10  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
401 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
396 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 
362 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 
411 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 
398 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 
411 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
319 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
372 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 
396 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  36.72 
 
 
424 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  36.9 
 
 
405 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
400 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
496 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
401 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
396 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  35.33 
 
 
427 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
406 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
396 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
404 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
320 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0966  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
343 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
539 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  36.9 
 
 
403 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
321 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
394 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
196 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
349 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0730  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
351 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0424443  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 
348 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
320 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
366 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  48.04 
 
 
452 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  39.55 
 
 
328 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
373 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>