140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0008 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  503  1e-142  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 
260 aa  120  1e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 
282 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
261 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
261 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.18 
 
 
242 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 
808 aa  96.3  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
283 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  31.82 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
328 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
328 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.11 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.19 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.08 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.65 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.78 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 
263 aa  82.8  4e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 
263 aa  82.8  4e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
249 aa  82.8  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 
258 aa  82.4  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
837 aa  82  8e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.05 
 
 
269 aa  81.3  1e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.05 
 
 
269 aa  81.3  1e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
231 aa  80.5  2e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 
257 aa  80.9  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 
249 aa  80.9  2e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 
255 aa  80.5  2e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
279 aa  74.7  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
264 aa  73.6  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
226 aa  73.9  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
287 aa  74.3  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.29 
 
 
259 aa  73.6  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.76 
 
 
338 aa  73.2  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.76 
 
 
338 aa  73.2  4e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
244 aa  72  7e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.76 
 
 
1153 aa  70.5  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
232 aa  70.9  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 
243 aa  69.7  3e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
258 aa  70.1  3e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.14 
 
 
281 aa  69.3  5e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 
253 aa  68.9  7e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.88 
 
 
639 aa  68.6  9e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 
639 aa  65.5  8e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 
228 aa  65.5  9e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
230 aa  64.7  1e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.29 
 
 
591 aa  64.3  2e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.89 
 
 
233 aa  63.2  3e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  29.39 
 
 
277 aa  63.2  4e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  29.62 
 
 
286 aa  62.4  6e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
271 aa  60.1  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
236 aa  58.9  6e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
245 aa  58.2  1e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.1 
 
 
285 aa  57.8  2e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 
285 aa  57.4  2e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  57.4  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
276 aa  56.2  4e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34924e-06 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.61 
 
 
285 aa  56.2  5e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
282 aa  56.2  5e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
271 aa  55.8  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
292 aa  55.5  8e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  28.92 
 
 
245 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  28.92 
 
 
245 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 
257 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  29.53 
 
 
270 aa  54.3  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.83 
 
 
251 aa  53.5  3e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
257 aa  53.5  3e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.52 
 
 
299 aa  53.1  3e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
245 aa  53.5  3e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.96 
 
 
231 aa  52.8  5e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
266 aa  52.8  5e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
243 aa  52.8  5e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.75 
 
 
235 aa  52.4  6e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.45 
 
 
257 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  26.34 
 
 
302 aa  52.4  7e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
264 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
257 aa  51.2  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
256 aa  51.6  1e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 
278 aa  52  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.59 
 
 
276 aa  51.6  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
257 aa  52  1e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 
264 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 
264 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
257 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 
260 aa  51.2  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
250 aa  50.8  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
247 aa  50.1  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
262 aa  49.7  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 
291 aa  49.3  6e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 
236 aa  49.3  6e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
251 aa  48.9  8e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.32 
 
 
253 aa  48.9  8e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
255 aa  48.5  9e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
255 aa  48.5  9e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.39 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>