50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3313 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 462 aa  938    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  42.83 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  42.35 
 
 		 479 aa  310  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  40.64 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  31.41 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  27.86 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  28.39 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  33.01 
 
 		 399 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.88 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  30.15 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  27.56 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  27.84 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  26.72 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  27.25 
 
 		 499 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  27.54 
 
 		 418 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  26.96 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  24.89 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  27.14 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  30.32 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  27.78 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  29.33 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  27.57 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  29.96 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  25.87 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  25.93 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  23.51 
 
 		 559 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  23.51 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  27.02 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  24.78 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  25.95 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  26.84 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  24.07 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  22.82 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  23.84 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  24.06 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  24.06 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  23.84 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  25.69 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  22.12 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  25.95 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  25.42 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  22.12 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  24.43 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  24.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  25.97 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  20.79 
 
 		 357 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>