More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3150 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  69.21 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  60 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  60.26 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  61.06 
 
 		 304 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  60.53 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  59.61 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  59.41 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  58.88 
 
 		 305 aa  358  8e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  58.88 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  57.05 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  59.8 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  54.93 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  56.72 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  52.9 
 
 		 310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  55.19 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  48.34 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  48.34 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  48.34 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  48.34 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  48.34 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  48.34 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  48.04 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  48.04 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  49.25 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  48.18 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  51.64 
 
 		 301 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  49.24 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  49.24 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  49.24 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  49.24 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  49.24 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  46.75 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  46.75 
 
 		 332 aa  291  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  46.75 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  45.12 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  45.45 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  45.26 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  44.34 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  50.34 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  47.65 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  42.77 
 
 		 343 aa  232  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  46.72 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  41.37 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  44.8 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  45.22 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  45.22 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  42.57 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  44.17 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  42.81 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  44.17 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  44.22 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  44.44 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  42.68 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  44.86 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  46.55 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  44.83 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  42.52 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  42.19 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  44.1 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  42.55 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  44.96 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  42.55 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  41.02 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.75 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  43.42 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  41.55 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  44.14 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  42.17 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  41.43 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  41.14 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  39.94 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  43.06 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  42.19 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  42.19 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  43.3 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  45.17 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  40.75 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  40.43 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  40.68 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.22 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.22 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.22 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  45.17 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  45.17 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  40.88 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  40.88 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  40.54 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  45.52 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  40.74 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  41.95 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>