More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1693 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  68.75 
 
 
192 aa  271  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
193 aa  259  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 
193 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
195 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.9 
 
 
482 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.61 
 
 
479 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.61 
 
 
479 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
181 aa  124  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.64 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.26 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
210 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
173 aa  118  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
207 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  35.47 
 
 
477 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  34.48 
 
 
474 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
166 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 
182 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
201 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
207 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
210 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 
210 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 
221 aa  104  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
210 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
207 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
170 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
212 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 
203 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
210 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 
219 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
209 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
209 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
203 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
203 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
215 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
209 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
212 aa  98.2  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
217 aa  95.1  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
214 aa  94.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 
209 aa  94.4  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
213 aa  91.7  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
217 aa  91.3  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
191 aa  91.3  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
232 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  30.13 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
219 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
214 aa  89  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
232 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
219 aa  87.8  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
176 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
179 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1721  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
211 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
229 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
172 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
232 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
236 aa  84.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
178 aa  84.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4468  orotate phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>