223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1078 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  100 
 
 		 296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  73.81 
 
 		 296 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  73.81 
 
 		 298 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0972  homoserine kinase  76.27 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.779201  normal  0.0398229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  36.79 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  37.08 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  31.67 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  35.03 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  31.51 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  32.89 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  33.22 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  34.63 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  31.29 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  31.48 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  33.33 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  31.42 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  36.26 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  30.69 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  39.01 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  32.91 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.15 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  35.23 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  36.65 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  33.93 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  32.69 
 
 		 320 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  36.61 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  31.67 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  33.55 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  32.67 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  30.33 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  29.18 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  29 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  35.71 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  30.4 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  34.34 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  30.4 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  30.4 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  30.4 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.62 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  30.4 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  37.5 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.92 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.2 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  31.14 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  34.08 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.89 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  32.43 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  29.56 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  30.13 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  29.56 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.03 
 
 		 303 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  30.51 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  30.63 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  31.43 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  31.35 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  29.2 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  28.28 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  29.15 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  31.63 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.95 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  28.77 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  28.77 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  30.43 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  29.79 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  28.97 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  27.01 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  28.23 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  28.47 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  27.34 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  28.28 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  31.34 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  28.62 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  33.45 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  32.88 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  28.15 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  28.15 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  28.15 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  28.33 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  32.27 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02930  homoserine kinase, putative  28.03 
 
 		 357 aa  92.8  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.614766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  28.63 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  28.1 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  26.87 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  28.57 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  27.02 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  28.08 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  27.02 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  28.85 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  28.72 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  30.34 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  33.92 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  31.85 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  28.85 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  27.87 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  26.33 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>