85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03479 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  100 
 
 
278 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  57.89 
 
 
281 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  47.06 
 
 
276 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  50.69 
 
 
223 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  34.87 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  35.43 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  33.98 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  29.05 
 
 
220 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  37.38 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  31.29 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  26.82 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  27.32 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  28.02 
 
 
249 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  35.79 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  28.02 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.09 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.82 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  28.02 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  28.02 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.32 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.02 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  28.02 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  28.02 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  36.97 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  34.9 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  23.98 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  32.22 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  40.2 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  31.15 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  31.34 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.74 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  23.19 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  23.19 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.19 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  39.29 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.47 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  22.71 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  31.48 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  35.92 
 
 
241 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  37.63 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  29.8 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3006  Abortive infection protein  32.03 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.969878  normal  0.541418 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  35.87 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  30.28 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1225  Abortive infection protein  30.49 
 
 
215 aa  47  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  28.82 
 
 
193 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  29.91 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21550  CAAX amino terminal protease family  29.88 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.37 
 
 
775 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  35.42 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  38.46 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  34.69 
 
 
420 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  35.34 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3281  abortive infection protein  30.61 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.13 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  22.61 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  39.8 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  37.62 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  34.38 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  31.52 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  27.83 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  31.87 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  30.51 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  30.51 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  35.42 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30.77 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  27.2 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  35.42 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.13 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.77 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  23.22 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  37.36 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2821  Abortive infection protein  39.08 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  31.19 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  30.43 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  32.67 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  31.91 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.63 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  24.54 
 
 
286 aa  42  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.01 
 
 
269 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.13 
 
 
278 aa  42  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>