40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3071 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  100 
 
 
251 aa  493  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3281  abortive infection protein  72 
 
 
253 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21550  CAAX amino terminal protease family  37.63 
 
 
317 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  39.5 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  39.5 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  31.79 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  29.14 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  29.95 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  31.85 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  33.08 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  32.31 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  33.08 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  36.84 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  36.84 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  27.91 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  32.97 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  30 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  33.7 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  26.35 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  26.35 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  29.8 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  26.25 
 
 
221 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  33.33 
 
 
227 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  31.58 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  30.58 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  26.51 
 
 
330 aa  45.8  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  36.96 
 
 
305 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  30.95 
 
 
515 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  32.95 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  32.14 
 
 
528 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0053  CAAX amino terminal protease family protein  20.83 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000276031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  32.53 
 
 
538 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0136  hypothetical protein  34.62 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.04 
 
 
420 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  27.66 
 
 
211 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  27.66 
 
 
211 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>