48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3281 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3281  abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  72 
 
 
251 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21550  CAAX amino terminal protease family  35.23 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  37.93 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  37.93 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.15 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  28.96 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  28.29 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  28.92 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  27.22 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  29.32 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  29.32 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  30.71 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  28.95 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  28.92 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  32.43 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  28.42 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  30.43 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  29.59 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  29.59 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  34.44 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0525  abortive infection protein  31.73 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  31.58 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  34.04 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  34.52 
 
 
515 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  33.77 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  26.99 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5328  Abortive infection protein  32.95 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0406  Abortive infection protein  34.21 
 
 
285 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  30.86 
 
 
192 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0397  Abortive infection protein  34.21 
 
 
285 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  32.31 
 
 
305 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  30.94 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  24.67 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  30.61 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  27.72 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  33.33 
 
 
528 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.7 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  34.62 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.57 
 
 
527 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.57 
 
 
527 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.04 
 
 
420 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  32.41 
 
 
193 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>