236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01194 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  100 
 
 
212 aa  426  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  66.49 
 
 
201 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  58.01 
 
 
206 aa  204  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  45.03 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  44.39 
 
 
197 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  45.83 
 
 
194 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  45.81 
 
 
194 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  44.21 
 
 
195 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  41.88 
 
 
193 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  44.79 
 
 
198 aa  157  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  45.83 
 
 
194 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  45.83 
 
 
194 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  43.52 
 
 
200 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  44.33 
 
 
194 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  49.72 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  43.68 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  48.35 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  49.72 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  47.8 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  45.45 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  49.74 
 
 
207 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.24 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  41.76 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  39.8 
 
 
204 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.18 
 
 
207 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.48 
 
 
205 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  36.76 
 
 
198 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.71 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  36.76 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.61 
 
 
245 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.71 
 
 
242 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  35.11 
 
 
204 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  42.33 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40.21 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.61 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  33.14 
 
 
195 aa  108  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  39.49 
 
 
194 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.84 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  26.74 
 
 
232 aa  107  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.95 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  42.76 
 
 
212 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.42 
 
 
204 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  36.84 
 
 
206 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  38.42 
 
 
195 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  36.36 
 
 
290 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  37.89 
 
 
195 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  35.86 
 
 
203 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 
194 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.14 
 
 
190 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  38.3 
 
 
195 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  36.31 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  36.88 
 
 
208 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.14 
 
 
210 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
211 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.8 
 
 
214 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  36.31 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  36.31 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  42.52 
 
 
212 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  41.5 
 
 
212 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.31 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.89 
 
 
210 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.18 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  34.72 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  37.18 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  37.18 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.9 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  38.85 
 
 
198 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.5 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  37.5 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  44.17 
 
 
200 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  43.7 
 
 
206 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  32.32 
 
 
211 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  38.95 
 
 
196 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  39.87 
 
 
199 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  38.61 
 
 
303 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  44.29 
 
 
195 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  38.61 
 
 
303 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  38.95 
 
 
196 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.61 
 
 
303 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  36.97 
 
 
213 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  40.85 
 
 
212 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  44.08 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  43.8 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  29.9 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  36 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  38.14 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.79 
 
 
195 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.79 
 
 
195 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.79 
 
 
195 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  39.01 
 
 
205 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.17 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  40.85 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  39.25 
 
 
204 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>