90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2486 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 345 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  83.19 
 
 		 341 aa  594  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  77.22 
 
 		 340 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  79.1 
 
 		 339 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  78.81 
 
 		 339 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  78.51 
 
 		 339 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  79.7 
 
 		 339 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  73.96 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  69.73 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  70.39 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  68.28 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  65.99 
 
 		 350 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  65.72 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  65.72 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  65.72 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  65.51 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  65.51 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  64.87 
 
 		 351 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  65.78 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  66.03 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.79 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.69 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.4 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  56.38 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  56.08 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  53.99 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.71 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  58.47 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  58.47 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.13 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.6 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  54.52 
 
 		 347 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.18 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  43.71 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  44.94 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  44.94 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.85 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.28 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.2 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  40.45 
 
 		 338 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  40.36 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.73 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37.33 
 
 		 338 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  38.91 
 
 		 327 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.49 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.39 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.2 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.2 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  40.06 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  40.8 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.34 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.74 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.9 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.24 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.91 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  33.55 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.19 
 
 		 119 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0183  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.59 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.44 
 
 		 369 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  20.5 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0365  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.58 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.796573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  22.32 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  22.32 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.06 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4566  taurine transporter substrate binding subunit  28.08 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.25 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.25 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0232  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  22.61 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5004  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  33.98 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  33.01 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.05 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  21.92 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.12 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0047  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  33.66 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0299581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.35 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  26.27 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31360  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  26.22 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2013  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.87 
 
 		 379 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  23.81 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4154  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.46 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  28.69 
 
 		 452 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>