64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0393 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  98.27 
 
 		 405 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  100 
 
 		 405 aa  831    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  63.76 
 
 		 380 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  64.81 
 
 		 388 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  64.85 
 
 		 375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  62.99 
 
 		 391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  64.2 
 
 		 344 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  48.99 
 
 		 495 aa  385  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  50.56 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  48.57 
 
 		 362 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  40.28 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  36.62 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  58.89 
 
 		 180 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  64.19 
 
 		 141 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  35.16 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  33.7 
 
 		 418 aa  195  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  34.04 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  35.73 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.98 
 
 		 359 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  30.59 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  31.18 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.35 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.78 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  27.03 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  25.13 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.17 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  22.49 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  23.46 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.36 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  27.59 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  22.49 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  22.49 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  28.28 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  25 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  25.29 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  24.19 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  24.19 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  24.67 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  24.19 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.87 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  24.23 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  28.93 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  32.35 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  35.71 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  29.23 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  33.85 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  37.04 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  32.84 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  30 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  25.15 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20.99 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  38.46 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  29.25 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>