44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13326 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  100 
 
 		 111 aa  237  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  49.09 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  45.83 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  55.17 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04219  RNA polymerase III subunit C11, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06380)  50 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267157  normal  0.568074 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  31.25 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  31.53 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  30.91 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  32.17 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  30.97 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  32.26 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  32.76 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  28.83 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  29.06 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  29.2 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  31.53 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  50 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  26.27 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  43.4 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  32.53 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  44.19 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  28.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  27.93 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  32.61 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  27.47 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  29.73 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  26.55 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  35.38 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  28.83 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  45.95 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  29.29 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  45 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  44.44 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.72 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  26.79 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  26.67 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  38.1 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  27.93 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  40.54 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.95 
 
 		 104 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  24.56 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  25 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>