45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42440 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  100 
 
 		 475 aa  975    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  30.32 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  30.64 
 
 		 187 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  28.82 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  32.97 
 
 		 1128 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  27.06 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  29.41 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  33.13 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  29.95 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  32.18 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  31.28 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  33.33 
 
 		 200 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  27.71 
 
 		 194 aa  59.7  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  29.47 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  29.45 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  33.52 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  28.66 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  33.09 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  32.02 
 
 		 189 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  33.33 
 
 		 196 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  30.95 
 
 		 192 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  28.12 
 
 		 190 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  28.75 
 
 		 181 aa  55.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  30.52 
 
 		 195 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  29.93 
 
 		 243 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  29.5 
 
 		 182 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  29.76 
 
 		 195 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  26.44 
 
 		 190 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  27.08 
 
 		 188 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  26.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  26.71 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  27.01 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  26.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  26.25 
 
 		 190 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  25.62 
 
 		 190 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  24.82 
 
 		 187 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  26.8 
 
 		 211 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  24.82 
 
 		 187 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  25.86 
 
 		 190 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  25.86 
 
 		 190 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  27.34 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  25.86 
 
 		 190 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  23.78 
 
 		 183 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  23.78 
 
 		 183 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  25.29 
 
 		 190 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>