139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37111 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37111  predicted protein  100 
 
 		 433 aa  880    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  27.03 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  30.49 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  28.28 
 
 		 306 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  24.76 
 
 		 309 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  32.4 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  29.88 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  31.6 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46360  predicted protein  25.61 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  26.93 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  26.53 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  26.32 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  27.6 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  31.3 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  31.3 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  31.3 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46336  predicted protein  28.57 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  29.2 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  29.02 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  29.02 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  26.71 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  30.87 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  29.02 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  29.02 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  30.87 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  29.02 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  29.02 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  29.02 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  25.84 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  24.15 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  22.07 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  25.59 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  27.49 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  29.02 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  27.17 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  28.63 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  28.46 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  29.24 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  29.18 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26635  predicted protein  24.38 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  27.12 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  26.14 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  27.49 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  24.32 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  28.17 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  27.95 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  25.65 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  28.89 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  25.38 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  27.8 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  24.33 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  27.75 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  27.75 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  29.43 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  27.75 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  27.31 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  25.5 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  28.26 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.08 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49488  predicted protein  28.82 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  28.08 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  22.57 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  24.39 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  24.01 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.29 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  27.71 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  25.44 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  24.8 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  25.68 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  26.91 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  25.33 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  22.67 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  26.35 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  24.35 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  26.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  25.39 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  25.25 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  23.39 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  24.69 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  22.11 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  24.83 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  23.97 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  28.37 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  23.81 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>