36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0670 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  100 
 
 		 379 aa  785    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  29.2 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  32.65 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.71 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  32.15 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.15 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.81 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.94 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.68 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.11 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 435 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  26.83 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.15 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.84 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.45 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  22.38 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.68 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.65 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  18.51 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  21.85 
 
 		 682 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  24.42 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>