More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0653 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
413 aa  838    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  58.56 
 
 
410 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  59.06 
 
 
405 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  56.28 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  56.78 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  55.64 
 
 
404 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  56.33 
 
 
412 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  55.28 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  56.03 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  54.26 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  55.28 
 
 
429 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  55.53 
 
 
408 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  54.77 
 
 
404 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  55.25 
 
 
438 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  57.18 
 
 
405 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  56.68 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  53.38 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  53.75 
 
 
406 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  56.17 
 
 
405 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  52.76 
 
 
404 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  53.38 
 
 
404 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  52.51 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  51.5 
 
 
415 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 
404 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 
404 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  47.98 
 
 
398 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.92 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  39.07 
 
 
432 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.31 
 
 
409 aa  259  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  38.59 
 
 
409 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  37.56 
 
 
419 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  38.6 
 
 
414 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  38.67 
 
 
406 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  38.05 
 
 
406 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  39.66 
 
 
407 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  38.41 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
419 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  40.24 
 
 
417 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  40.24 
 
 
417 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  40.24 
 
 
417 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  37.04 
 
 
429 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  37.34 
 
 
420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.69 
 
 
400 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  36.61 
 
 
421 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  37.99 
 
 
419 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  51.66 
 
 
400 aa  229  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  37.44 
 
 
403 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  51.66 
 
 
400 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  38.56 
 
 
410 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  37.86 
 
 
380 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  43.98 
 
 
303 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
435 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.34 
 
 
306 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.34 
 
 
306 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 
322 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  49.1 
 
 
326 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 
322 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
325 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
325 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  45.76 
 
 
317 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
325 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  43.93 
 
 
322 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.46 
 
 
325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
328 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
357 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  36.55 
 
 
326 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  46.34 
 
 
306 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  36.98 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  36.26 
 
 
326 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 
285 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 
326 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  35.84 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
330 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  43.1 
 
 
297 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.95 
 
 
278 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  44.89 
 
 
310 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 
322 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  39.62 
 
 
306 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
330 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>