More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4731 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 454 aa  935    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  56.7 
 
 		 455 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  56.7 
 
 		 455 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  54.7 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  54.43 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  53.19 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  52.76 
 
 		 448 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.53 
 
 		 442 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  40.04 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  41.63 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  35.93 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  35.68 
 
 		 446 aa  269  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  35.37 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  34.3 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  36.5 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  36.18 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  36.41 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 438 aa  242  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  35.77 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  35.66 
 
 		 437 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  36.1 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.36 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  36.55 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  31.98 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 		 437 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  32.22 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  30.68 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  33.76 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  34.01 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  30.71 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  34.33 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  31.29 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.03 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.67 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  33 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  31.42 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.67 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  30.57 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  28.96 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.45 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  31.42 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  29.76 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  33.33 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  43.03 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  30.5 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.77 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  28.64 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  32.3 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  30.55 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  29.46 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  30.54 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.59 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  27.63 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.93 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.91 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 		 426 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  30.73 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  29.44 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  29.4 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.68 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  26.89 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.2 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.2 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  29.8 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  29.01 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  27.57 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.17 
 
 		 441 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  30.08 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.95 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.95 
 
 		 423 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  27.04 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.49 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.95 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.32 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  35.98 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  29.07 
 
 		 423 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.34 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  30.55 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0073  ABC transporter, membrane component  31.77 
 
 		 405 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  27.76 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  28.82 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.82 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  28.82 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.82 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.82 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.57 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  26.6 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  27.07 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  30.09 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00831  ABC transporter, membrane component  37.45 
 
 		 405 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.208147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.22 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  26.3 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.3 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>