More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0049 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  77.32 
 
 
399 aa  640  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  77.56 
 
 
399 aa  645  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  90.73 
 
 
409 aa  726  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  80.73 
 
 
409 aa  655  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  80.73 
 
 
409 aa  650  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  100 
 
 
410 aa  830  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  90.73 
 
 
409 aa  726  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  77.32 
 
 
399 aa  642  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  77.8 
 
 
399 aa  645  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  77.56 
 
 
399 aa  645  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  77.8 
 
 
399 aa  646  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  76.83 
 
 
399 aa  642  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  81.46 
 
 
409 aa  668  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  76.1 
 
 
399 aa  639  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  77.56 
 
 
399 aa  645  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  85.37 
 
 
409 aa  691  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  85.37 
 
 
409 aa  695  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.41 
 
 
395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.52961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  75.85 
 
 
399 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.66 
 
 
400 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.84672e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.17 
 
 
400 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.88327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.9 
 
 
400 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.57985e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  70 
 
 
405 aa  613  1e-174  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  8.57759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.68 
 
 
400 aa  613  1e-174  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  70 
 
 
405 aa  613  1e-174  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.55 
 
 
400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  74.21 
 
 
405 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  74.21 
 
 
405 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  7.40208e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.55 
 
 
400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.89275e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.2 
 
 
399 aa  605  1e-172  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.06 
 
 
400 aa  604  1e-172  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.06 
 
 
400 aa  604  1e-172  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.07043e-08  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.44 
 
 
399 aa  605  1e-172  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  1.00394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  71.29 
 
 
405 aa  601  1e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.95 
 
 
399 aa  601  1e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.96784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.2 
 
 
397 aa  601  1e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.07786e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  71.53 
 
 
405 aa  603  1e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.2 
 
 
397 aa  601  1e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  71.88 
 
 
400 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.94067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.05 
 
 
399 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.85931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.24 
 
 
400 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.58382e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.29 
 
 
399 aa  597  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.40706e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  71.88 
 
 
400 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.59 
 
 
400 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.29 
 
 
399 aa  597  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  1.11535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.29 
 
 
399 aa  597  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  72.3 
 
 
399 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  72.3 
 
 
400 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  70.59 
 
 
400 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.09 
 
 
396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.09 
 
 
396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.68 
 
 
396 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.86 
 
 
396 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  72.86 
 
 
396 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  69.83 
 
 
400 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.57 
 
 
396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  69.83 
 
 
400 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.57 
 
 
396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.15 
 
 
395 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.45051e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  73.9 
 
 
395 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.09 
 
 
396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  72.68 
 
 
396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  72.68 
 
 
396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.09 
 
 
396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  5.42381e-07  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  73.9 
 
 
395 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.29876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.2 
 
 
396 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.44 
 
 
396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  72.62 
 
 
396 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  72.62 
 
 
396 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.66 
 
 
394 aa  590  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  7.67064e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  71.53 
 
 
396 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  70.87 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.79 
 
 
396 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  71.12 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  71.53 
 
 
396 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  71.95 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  71.95 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  4.68547e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.06645e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  71.46 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.5318e-08  hitchhiker  3.10582e-11 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  9.51262e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  7.12008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  71.08 
 
 
402 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.63409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  71.46 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.50336e-07  hitchhiker  1.30036e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.12 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.73215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.79 
 
 
396 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.12 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  71.71 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  3.03162e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>