74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2818 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  100 
 
 		 257 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  85.99 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  49.59 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  48.76 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.91 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.91 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  45.54 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  44.24 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  44.24 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  44.24 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  44.24 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  44.24 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  44.24 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  44.24 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  45 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  43.15 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.44 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  42.22 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  38.3 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  38.66 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  38.24 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  38.24 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.96 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  33.19 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  35.21 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.82 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.49 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.91 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  30.13 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.07 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  29.6 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.85 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.07 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  27.23 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  27.23 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.18 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  27.83 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  28.45 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  25.84 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  29.06 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  29.13 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  24.88 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  27.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  25.91 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  30.08 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  25.48 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  26.16 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  21.9 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  24.64 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.05 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.57 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  27.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  27.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  27.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  23.98 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  28.26 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  25.42 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  26.29 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  27.21 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  26.29 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  26.29 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  27.21 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  27.21 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  24.28 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  23.97 
 
 		 246 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  24.58 
 
 		 253 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>