More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20681 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  100 
 
 		 450 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  65.66 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  68.65 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  56.84 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  54.84 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  54.61 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  44.08 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  44.55 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  44.08 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  43.85 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  48.64 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  45.56 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  45.54 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  44.72 
 
 		 446 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  45.38 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  45.38 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  41.63 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  43.07 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  38.53 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  39.37 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  39.64 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.48 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  38.88 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  37.35 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.43 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.69 
 
 		 451 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  38.2 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  36.75 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  37.47 
 
 		 453 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.3 
 
 		 448 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.56 
 
 		 462 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.75 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.25 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.56 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  34.99 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.05 
 
 		 447 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.01 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.01 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.01 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.01 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.79 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.38 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.55 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  35.73 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.79 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  31.55 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.79 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  36.19 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.98 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.79 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  33.33 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.09 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.34 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.35 
 
 		 429 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.06 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.25 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  36.79 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  33.26 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  34.78 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.44 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  33.81 
 
 		 444 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  36.56 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.04 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  35.59 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  35.84 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.9 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  34.13 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  35.35 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.66 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  37.02 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  37.65 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  35.35 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  36.27 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.82 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.86 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.82 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  36.27 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.37 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  37.84 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.36 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  38.65 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  36.18 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  35.8 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  35.12 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  36.41 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  35.29 
 
 		 429 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  32.08 
 
 		 449 aa  199  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  36.41 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  36.41 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.98 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.73 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  35.1 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.2 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>