84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  100 
 
 
389 aa  782    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  83.68 
 
 
390 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  74.81 
 
 
391 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  74.81 
 
 
391 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  74.04 
 
 
389 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  71.21 
 
 
389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  70.21 
 
 
390 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  70.21 
 
 
390 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  69.61 
 
 
390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  70.94 
 
 
390 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  51.83 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  48.17 
 
 
384 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  49.74 
 
 
385 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  48.96 
 
 
385 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  48.95 
 
 
388 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  47.91 
 
 
384 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  46.86 
 
 
388 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  42.89 
 
 
390 aa  348  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  45.31 
 
 
385 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  44.76 
 
 
383 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  44.39 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  44.76 
 
 
383 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  43.62 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  43.29 
 
 
395 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  41.9 
 
 
392 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  40.57 
 
 
397 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  42.93 
 
 
392 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  38.85 
 
 
385 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  34.03 
 
 
393 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  31.66 
 
 
402 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
407 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
392 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  26.63 
 
 
402 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 
377 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.42 
 
 
376 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
414 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
376 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.11 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  31.69 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  27.49 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.8 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.32 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.23 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  23.02 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  24.56 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  23.98 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  23.06 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  22.56 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  22.84 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  23.65 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  20.45 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  23.64 
 
 
378 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  23.7 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  22.36 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.85 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  20.45 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  28.24 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.34 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  26.02 
 
 
401 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  26.49 
 
 
380 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  30.77 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.94 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  26.4 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  20.91 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25.43 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.81 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  20.27 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  25.84 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>