47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2783 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1518  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000454364  hitchhiker  0.00000000880332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 
586 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.53 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  22.31 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  32.17 
 
 
1076 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  25.7 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 
788 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 
460 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 
940 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
639 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.27 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.08 
 
 
788 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 
788 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
480 aa  46.6  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  26.5 
 
 
1577 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
265 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  31.58 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
810 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.72 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.03 
 
 
788 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.5 
 
 
639 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.38 
 
 
788 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.75 
 
 
788 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.75 
 
 
788 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.61 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0247  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.36 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.8 
 
 
826 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.55 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.39 
 
 
788 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  26.52 
 
 
1512 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.29 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.39 
 
 
583 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
592 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 
356 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>